رشته مکاترونیک از سال ۱۳۸۳ در دانشگاههای ایران تشکیل شده‌است.
مانند بسیاری از نقاط جهان، سرفصل‌های یکسانی در دانشگاه‌ها اجرا نمی‌شود و رشته مکاترونیک توسط اساتید مکانیک، و در برخی دانشگاه‌ها توسط اساتید برق، مدیریت می‌شوند. طبیعتا نوع نگاه به مواد درسی نیز با نگرش مدیر گروه‌های دانشگاه‌ها فرم می‌پذیرد.
دانشگاه آزاد اسلامی واحد علوم و تحقیقات و دانشگاه آزاد قزوین اولین دانشگاههای ایران هستند که رشته مکاترونیک را دایر کرده‌اند.
بر اساس دفترچه کارشناسی ارشد فنی و مهندسی سال 1389 دانشگاه صنعتی خواجه نصیرالدین طوسی، دانشگاه تبریز، دانشگاه صنعتی امیرکبیر، دانشگاه سمنان، دانشگاه آزاداسلامی واحد تهران جنوب و دانشگاه آزاداسلامی واحد علامه مجلسی اصفهان، دانشگاه صنعتی شریف، دانشگاه صنعتی شاهرود، دانشگاه ازاد اسلامی واحد اهر و دانشگاه سیستان و بلوچستان در مقطع کارشناسی ارشد این رشته وجود دارد.
این رشته برای اولین بار در مقطع کارشناسی در دانشگاه تربیت معلم سبزوار ایجاد گردیده است.